復(fù)旦大學(xué)附屬兒科醫(yī)院創(chuàng)建于1952年，系衛(wèi)生部部署三級甲等醫(yī)院，是集醫(yī)、教、研為一體的綜合性兒童專科醫(yī)院，是全國兒科學(xué)重點學(xué)科、國家“211工程”和“985”工程建設(shè)單位，是最早被國家授予兒科學(xué)碩士、博士學(xué)位授權(quán)點、臨床醫(yī)學(xué)（兒科學(xué)組）博士后流動站的單位。在中國最佳醫(yī)院專科排行榜中，綜合排名首次居全國兒童醫(yī)院榜首，兒內(nèi)科繼續(xù)名列第一，兒外科繼續(xù)名列第二。多次被評為上海市文明單位。
　　醫(yī)院宗旨：一切為了孩子。醫(yī)院使命：建樹醫(yī)學(xué)典范，呵護兒童健康。醫(yī)院定位：立足上海、服務(wù)全國、輻射亞洲。醫(yī)院愿景：亞洲一流的兒童醫(yī)學(xué)中心，兒科醫(yī)學(xué)教育向全國輻射的中心，中外兒科學(xué)術(shù)交流的重要橋梁。醫(yī)院院訓(xùn)：團結(jié)、奮進、嚴謹、創(chuàng)新。醫(yī)院理念：尊重、平等、熱情、關(guān)愛。
　　在各級政府的大力支持和關(guān)心下，2008年2月29日，座落于閔行區(qū)萬源路399號的新醫(yī)院經(jīng)過將近4年的建設(shè)正式啟用，醫(yī)院主體從楓林路搬遷至新醫(yī)院，原址保留普通兒內(nèi)科門診服務(wù)功能，以滿足周邊地區(qū)病人的需求。新醫(yī)院占地153畝，Ⅰ期建筑面積8萬多平方米，核定床位由原來的330張增至600張，現(xiàn)開放床位711張。截止2013年底，職工1396人，博士生導(dǎo)師30名，碩士生導(dǎo)師33名，高級職稱專家118人。
　　醫(yī)院開放床位71張，年門急診服務(wù)量逾221萬，出院病人突破3.5萬人次，住院手術(shù)近1.6萬。醫(yī)院專業(yè)設(shè)置齊全，共設(shè)45個臨床醫(yī)技科室，新生兒、重癥醫(yī)學(xué)科、小兒消化科、中醫(yī)兒科、新生兒疾病重點實驗室、小兒外科、臨床護理被確定為國家臨床重點專科。新生兒、外科、心血管、傳染病等專業(yè)曾先后被列為衛(wèi)生部臨床學(xué)科重點專業(yè)。新生兒科是上海市醫(yī)學(xué)重點學(xué)科，兒科學(xué)是上海市重中之重重點學(xué)科，小兒外科是上海市小兒外科疑難重癥臨床醫(yī)學(xué)中心，呼吸急救專業(yè)是上海市醫(yī)學(xué)領(lǐng)先專業(yè)。
　　醫(yī)院科研實力雄厚，近10年來承擔470項科研課題，經(jīng)費2億元。包括國家自然科學(xué)基金重點課題、衛(wèi)生部臨床學(xué)科重點專業(yè)、國家“863”、“973”、“十一五”、“十二五”科技支撐計劃等重要項目。
　　2012年醫(yī)院啟動“騰飛計劃”（1125人才工程），利用985創(chuàng)新平臺、重大科技項目或海外特聘教授崗位等吸引海外著名學(xué)者來院開展科研合作，先后引入21位國內(nèi)外知名教授作為雙聘PI。醫(yī)院有2個省部級重點實驗室，分別為衛(wèi)生部新生兒疾病重點實驗室和上海市出生缺陷防治重點實驗室。
　　復(fù)旦大學(xué)上海醫(yī)學(xué)院兒科學(xué)系設(shè)在兒科醫(yī)院，每年承擔七個專業(yè)400余名醫(yī)學(xué)生的臨床教學(xué)與實習(xí)培養(yǎng)。已為全國各地培養(yǎng)進修醫(yī)生6000余名，每年培養(yǎng)長期進修學(xué)員200余名，每年培養(yǎng)短期參觀學(xué)習(xí)學(xué)員200余名。每年舉辦近30-40期國家級繼續(xù)教育學(xué)習(xí)班。做為上海市住院醫(yī)師規(guī)范化培養(yǎng)基地，每年培養(yǎng)30余名住院醫(yī)師，2012年做為上海市專科醫(yī)師培養(yǎng)基地開始進行專科醫(yī)師規(guī)范化的培養(yǎng)。每年培養(yǎng)博士研究生20余名，碩士研究生40余名.
　　醫(yī)院每年接待外賓講學(xué)、交流100余次。醫(yī)院先后與美國、加拿大等國家的20多個國際上知名的醫(yī)學(xué)機構(gòu)和國內(nèi)20多個單位建立密切協(xié)作關(guān)系。醫(yī)院平均每年主辦3次大型兒科國際學(xué)術(shù)會議，近兩年分別成功主辦孤獨癥研究國際合作發(fā)展論壇、第43屆太平洋小兒外科年會、第16屆國際兒科腎臟病大會。
　　近11年來(2003年-2013年)獲學(xué)科建設(shè)和科研項目共計286項，其中國家級課題121項，SCI收錄論文550篇（近4年來295篇），獲省部級以上獎項28項。并出版《實用新生兒學(xué)》、《小兒感染病學(xué)》、《現(xiàn)代實用兒科學(xué)》等十余部重要專著。主辦《中國兒科循證雜志》進入國家核心期刊，并與美國兒科學(xué)會協(xié)作主辦《Pediatrics中文版》。
　　兒科人以“一切為了孩子”為宗旨，以“團結(jié)、奮進、嚴謹、創(chuàng)新”的院訓(xùn)勉勵自己，貫穿“以人為本”的服務(wù)理念，構(gòu)建和諧穩(wěn)定的醫(yī)院文化，營造規(guī)范有序的良好氛圍，在全國享有較高的聲譽。