福建醫(yī)科大學(xué)附屬第二醫(yī)院、第二臨床醫(yī)學(xué)院是泉州地區(qū)現(xiàn)代醫(yī)學(xué)的發(fā)祥地，是我省主要的醫(yī)療、教學(xué)、科研基地之一，是閩南地區(qū)最早的一所三級(jí)甲等綜合性醫(yī)院及博士、碩士研究生學(xué)位授權(quán)點(diǎn)單位。醫(yī)院始建于1881年，為英國教會(huì)醫(yī)院，原名“惠世醫(yī)院”，解放后，改為晉江專區(qū)第二醫(yī)院。1973年升格為福建醫(yī)科大學(xué)附屬第二醫(yī)院。2000年成為福建醫(yī)科大學(xué)第二臨床醫(yī)學(xué)院，2002年成為福建醫(yī)學(xué)會(huì)風(fēng)濕病學(xué)分會(huì)主任委員單位。

　　福建醫(yī)科大學(xué)附屬第二醫(yī)院倡導(dǎo)科學(xué)精神與人文精神相結(jié)合的治院方略，歷來以外科技術(shù)精湛著稱，上世紀(jì)四、五十年代率先在泉州地區(qū)開展大、中型外科手術(shù)，并為泉州地區(qū)培養(yǎng)了大批醫(yī)學(xué)骨干力量。近二十年來，內(nèi)科領(lǐng)域在相關(guān)學(xué)科帶頭人開拓領(lǐng)導(dǎo)下，學(xué)科建設(shè)長(zhǎng)足發(fā)展，多個(gè)二級(jí)專業(yè)躍入省內(nèi)先進(jìn)水平，其中自身免疫風(fēng)濕病專業(yè)省內(nèi)領(lǐng)先。現(xiàn)任院長(zhǎng)是我省自身免疫風(fēng)濕病學(xué)科帶頭人、博士生導(dǎo)師、國家衛(wèi)生部有突出貢獻(xiàn)中青年專家。

　　福建醫(yī)科大學(xué)附屬第二醫(yī)院原址地處歷史文化名城---僑鄉(xiāng)泉州，占地僅約25畝，建筑面積48285平方米，病床編制970張，在職職工1120人，高級(jí)職稱人員270人，有衛(wèi)生部有突出貢獻(xiàn)中青年專家1人、國務(wù)院特殊津貼專家5人，擔(dān)任專業(yè)學(xué)會(huì)主任委員1人，各專業(yè)學(xué)會(huì)副主任委員（副會(huì)長(zhǎng)）20人;占地142.6畝、床位1000張的“東海院區(qū)”按總體規(guī)劃、分步實(shí)施的原則實(shí)施建設(shè)，一期工程已實(shí)行代建制，計(jì)劃2010年底完工投入使用。

　　福建醫(yī)科大學(xué)附屬第二醫(yī)院臨床、醫(yī)技科室齊全，在免疫內(nèi)科、呼吸內(nèi)科、心血管內(nèi)科、腎臟內(nèi)科、泌尿外科、內(nèi)分泌科、骨科、耳鼻喉科、影像介入科、普外科、胸心血管外科、婦產(chǎn)科和眼科等專科尤為專長(zhǎng)，其中自身免疫病的診斷和治療、腹部介入超聲、呼吸介入技術(shù)、心血管超聲診斷技術(shù)、微創(chuàng)外科技術(shù)達(dá)到省內(nèi)領(lǐng)先或國內(nèi)先進(jìn)水平。醫(yī)院擁有核磁共振成像系統(tǒng)（MRI）、數(shù)字減影血管造影機(jī)(DSA)、螺旋CT、數(shù)字化胃腸造影機(jī)、流式細(xì)胞儀、PCR儀、彩色多普勒超聲心動(dòng)圖、腹部彩色超聲波、血液透析機(jī)、體外循環(huán)機(jī)、電子直線加速器、數(shù)字高頻攝片機(jī)、骨密度儀、乳腺鉬靶、體外震波碎石機(jī)、神經(jīng)電生理檢查儀、電子胃鏡、電子腸鏡、電子支氣管鏡等先進(jìn)儀器設(shè)備。優(yōu)秀的人才、精良的設(shè)備和完備的醫(yī)學(xué)專科為廣大民眾提供了全方位的醫(yī)療、保健服務(wù)，醫(yī)院目前年門診量超70萬人次、住院量3萬多人次、完成各類手術(shù)1.6萬余臺(tái)。

　　作為福建醫(yī)科大學(xué)第二臨床醫(yī)學(xué)院及省級(jí)醫(yī)學(xué)繼續(xù)教育基地之一，設(shè)有13個(gè)醫(yī)學(xué)教研室，現(xiàn)有正、副教授91人，博士研究生導(dǎo)師4人、碩士研究生導(dǎo)師36人，1998年開始招收全國統(tǒng)招碩士研究生、2003年開始招收全國統(tǒng)招博士研究生，迄今共招收博、碩士研究生201名，目前在院研究生、本科生近300人。

　　福建醫(yī)科大學(xué)附屬第二醫(yī)院還依托自身免疫病研究室、介入超聲研究室、肝膽研究二室、耳鼻喉研究三室、手外科研究室、糖尿病研究室、腎病研究室、骨科生物力學(xué)研究室、睡眠呼吸研究室等9個(gè)研究室和科研中心，倡導(dǎo)“創(chuàng)新、求實(shí)、嚴(yán)謹(jǐn)、規(guī)范”實(shí)驗(yàn)室室訓(xùn)，大力開展醫(yī)學(xué)科學(xué)研究，1997年以來共有59項(xiàng)科研成果獲得醫(yī)學(xué)科學(xué)技術(shù)進(jìn)步獎(jiǎng)，173項(xiàng)研究項(xiàng)目得到政府或研究基金的資助。

　　1981年，經(jīng)省政府批準(zhǔn)，醫(yī)院在本省率先建立華僑門診、華僑病區(qū)。二十多年來接受大量來自美國、日本、新加坡、菲律賓、印度尼西亞、香港、臺(tái)灣及其他東南亞地區(qū)的病人。愛國僑胞熱心桑梓、慷慨解囊為醫(yī)院的建設(shè)作出了積極的貢獻(xiàn)。福建醫(yī)科大學(xué)附屬第二醫(yī)院歷任領(lǐng)導(dǎo)及全體同仁都非常珍視廣大僑胞及社會(huì)各界對(duì)該醫(yī)院的關(guān)愛及支持。