中國人民解放軍西藏軍區(qū)總醫(yī)院前身是川東軍區(qū)直屬醫(yī)院，1949年11月組建于重慶市長壽縣，1955年更名為陸軍第49醫(yī)院，同年奉命進藏。1962年被命名為西藏軍區(qū)總醫(yī)院，并遷入現(xiàn)址。　　

醫(yī)院占地面積約41萬余平方米，建筑面積7萬余平方米；編制床位400張，現(xiàn)展開床位550張；編制干部、戰(zhàn)士550人，現(xiàn)有645人；設(shè)有4部機關(guān)，14個行政科室，29個臨床、醫(yī)技科室，以及全軍高山病防治研究中心、全軍拉薩血站、成都軍區(qū)創(chuàng)傷外科中心、西藏軍區(qū)制劑中心、自治區(qū)醫(yī)學(xué)重點實驗室和中西醫(yī)結(jié)合研究所；同時為第三軍醫(yī)大學(xué)拉薩臨床醫(yī)學(xué)院、西藏大學(xué)教學(xué)醫(yī)院，是集醫(yī)療、科研、教學(xué)和保健為一體的三級甲等醫(yī)院。　　

醫(yī)院擁有磁共振、數(shù)字減影、CT、X光機、大型高壓氧艙群、中心監(jiān)護系統(tǒng)等價值4000余萬元的醫(yī)療設(shè)備；有博士生導(dǎo)師1人、碩士生導(dǎo)師3人、博士后4人、博士研究生13人、碩士研究生48人，臨床一線醫(yī)生全部達到了大學(xué)本科以上學(xué)歷。　　

“九五”期間，全院共獲科技進步獎112項，其中：國家科技進步三等獎l項，軍隊科技進步二等獎6項，自治區(qū)科技進步一等獎2項，自治區(qū)科技進步二等獎8項，軍隊科技進步三等獎33項，軍隊科技進步四等獎62項。