成都肛腸專科醫(yī)院源于著名痔瘺泰斗黃濟川先生于1884年在四川瀘州開辦的痔瘺診所，1904年遷移至成都少城，稱黃濟川痔瘺醫(yī)院。1956年改制后正式成為全國第一家公立肛腸專科醫(yī)院，稱成都痔瘺專科醫(yī)院。1998年由成都市衛(wèi)生局更名為成都肛腸專科醫(yī)院，2012年成為國家二級甲等專科醫(yī)院，同年順利通過了國家三級乙等專科醫(yī)院評審。
　　20世紀50年代，黃老用其高超獨到的祖?zhèn)髅胤綖橐恍┲匾I導診治后，其醫(yī)術享譽九州，受到周總理親切接見與鼓勵。新中國中醫(yī)外科四大名醫(yī)黃濟川、石筱山、杜自明、趙炳南，于1956年7月躋身于中華醫(yī)學會外科學會常務委員。其中黃濟川與“中國外科之父”裘法祖等一起任學會四位副主任委員之一，獲得了中醫(yī)外科在我國醫(yī)學史上最高的學術地位。同時黃濟川也是四川省最早的四大名中醫(yī)之一（黃濟川、張文修、李斯熾、卓雨農(nóng)）。
三個世紀以來，醫(yī)院大力弘揚祖國醫(yī)學的優(yōu)良傳統(tǒng)，繼承和發(fā)揚黃老先生豐富的肛腸醫(yī)學遺產(chǎn)，運用現(xiàn)代醫(yī)學創(chuàng)立了一整套獨具中西醫(yī)結(jié)合專科特色的治療方法，醫(yī)院堅持走“大專科，小綜合”發(fā)展之路，至今已為國內(nèi)外數(shù)百萬計的肛腸病患者解除了病痛。
　　目前醫(yī)院開放病床208張，下設8個臨床科室，并設立了全國首個肛腸VIP病區(qū)及全國首個便秘病區(qū)。擁有大腸肛門病專業(yè)主任醫(yī)師7人，副主任醫(yī)師25人，麻醉師6人。在醫(yī)教研各方面齊抓共管，目前擁有碩、博士研究生21人，承擔部、省、市、區(qū)各級課題20余項。醫(yī)院黨政領導歷年來高度重視教學，把教學工作作為關系醫(yī)院發(fā)展的戰(zhàn)略任務來抓，“科教興醫(yī)、科教興院，以教學促醫(yī)療、促醫(yī)院發(fā)展”已成為醫(yī)院上下的共識，醫(yī)院規(guī)模、科室設置、診療儀器設備、住宿條件、教學設施、聲像、圖書資料等教學條件能滿足臨床教學需要。醫(yī)院擁有手術室9間，先進數(shù)字化動態(tài)平板攝影系統(tǒng)，丹麥造彩色多普勒超聲診斷掃描儀，日本奧林巴斯電子腸鏡，丹麥造胃腸動力學檢查系統(tǒng)等價值1500余萬大型專科設備。醫(yī)院教學管理規(guī)范有序，管理機構(gòu)完整，崗位職責明確，管理制度健全，師資隊伍結(jié)構(gòu)合理穩(wěn)定，認真組織實施教學，各項教學任務得到落實。真正達到“以評促教、以評促改，教學相長，以教學促科研、以教學促醫(yī)療”的目的，促進醫(yī)院可持續(xù)發(fā)展。
　　醫(yī)院目前是國家中醫(yī)藥管理局重點學科單位，國家中醫(yī)藥管理局重點專科單位，四川省醫(yī)學甲級重點專科——肛腸科，醫(yī)院設有“全國中醫(yī)肛腸學科名專家”工作室2個，“四川省名中醫(yī)”工作室1個，“成都市名中醫(yī)”工作室1個。擁有四川省中醫(yī)藥學會副秘書長1人；四川省中西醫(yī)結(jié)合學會副會長1人；成都市中醫(yī)藥學會副理事長1人；中國PPH技術（規(guī)范）資格認證專家委員會主任委員、秘書長各1人；中國便秘聯(lián)誼會主席2人、會長1人、秘書長1人、副會長1人、常務副秘書長1人、副秘書長1人、常務理事10人；中醫(yī)藥高等教育學會肛腸分會顧問會長1人、秘書長1人、副會長2人、副秘書長1人、常務理事7人；中華中醫(yī)藥學會肛腸分會副會長1人、副秘書長1人、常務理事7人；世界中醫(yī)藥學會聯(lián)合會肛腸專業(yè)委員會副會長1人、副秘書長1人、常務理事1人；中國中西醫(yī)結(jié)合學會大腸肛門病專業(yè)委員會常務理事1人；四川省中醫(yī)藥學會肛腸專業(yè)委員會正副主任委員各1人；成都市中醫(yī)藥學會肛腸專業(yè)委員會正副主任委員各1人；中國肛腸病學研究生聯(lián)合會正副會長、秘書長各1人。